1面2線の島式ホーム。電車は新さっぽろ側の転てつ機から空いている方のホームに進入し、折り返し運転を行う。西側は留置線となっており、それぞれ1編成ずつ留置が可能である。ホームと改札の間にはエレベーター・エスカレーターが設置されている。エスカレーターは
大通駅などと異なり、上りと下りで逆を向いて設置されている。
出口は7ヶ所あり、地上へのエレベーターは1・4・6番出口に設置されている。5番出口・バスターミナルへの通路は長く、この間には札幌市営地下鉄の駅で唯一の動く歩道がある。また、1番出口は南北線
麻生駅1番出口同様、階段を一度下りてからまた上る構造になっている。そのため、1番出口へ通じる通路の途中にも通路移動の為のエレベーターが存在する。